Запалення, яке виникає внаслідок хвороби Хашимото, яку ще також називають хронічним аутоімунним (лімфоцитарним) тиреоїдитом, часто призводить до гіпотиреозу – недостатньої роботи щитоподібної залози. Тиреоїдит Хашимото найпоширеніша причина виникнення гіпотиреозу.

Лікування хвороби Хашимото є доволі простим та ефективним. Але є одне "але" пацієнт мусить пожиттєво приймати синтетичні аналоги гормонів щитоподібної залози, дозу яких підбирає (і регулярно переглядає) лікар.